Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cdkl1Q8CEQ0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cdkl1Q8CEQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms