Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN6

Txnl1, Thioredoxin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnl1Q8CDN6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Txnl1Q8CDN6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Txnl1Q8CDN6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms