Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RybpQ8CCI5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms