Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1W1

Vash1, Vasohibin-1, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vash1Q8C1W1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Vash1Q8C1W1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Vash1Q8C1W1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vash1Q8C1W1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Vash1Q8C1W1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Vash1Q8C1W1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Vash1Q8C1W1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Vash1Q8C1W1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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