Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Atg16l1Q8C0J2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms