Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FarsaQ8C0C7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms