Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm31925-201ENSMUST00000193561 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trim35Q8C006 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trim35Q8C006 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Trim35Q8C006 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm31831-201ENSMUST00000196240 684 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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