Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Pggt1bQ8BUY9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pggt1bQ8BUY9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms