Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd3Q8BHD4 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd3Q8BHD4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms