Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.6Q85ZW5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.6Q85ZW5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.6Q85ZW5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms