Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hapln4Q80WM4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hapln4Q80WM4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms