Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pnma8aQ80VM8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pnma8aQ80VM8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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