Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otop3Q80UF9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otop3Q80UF9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otop3Q80UF9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Otop3Q80UF9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Otop3Q80UF9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Otop3Q80UF9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms