Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm25509-201ENSMUST00000116985 106 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Znf516Q7TSH3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Znf516Q7TSH3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms