Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1cQ7TSF0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1cQ7TSF0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms