Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN88

Pkd1l2, Polycystic kidney disease protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd1l2Q7TN88 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkd1l2Q7TN88 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkd1l2Q7TN88 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms