Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Syne1Q6ZWR6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms