Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pcp4l1Q6W8Q3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms