Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp8b3Q6UQ17 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp8b3Q6UQ17 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms