Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vstm2lQ6PDS0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vstm2lQ6PDS0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms