Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rundc3bQ6PDC0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rundc3bQ6PDC0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms