Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Herc4Q6PAV2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Herc4Q6PAV2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms