Protein–RNA interactions for Protein: Q6P539

Fam222b, Protein FAM222B, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam222bQ6P539 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam222bQ6P539 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms