Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Frg2f1Q6P3A2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Frg2f1Q6P3A2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms