Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Paxip1Q6NZQ4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Paxip1Q6NZQ4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms