Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cep78Q6IRU7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cep78Q6IRU7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms