Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp7Q6A4J8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Usp7Q6A4J8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp7Q6A4J8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms