Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rab3ipQ68EF0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rab3ipQ68EF0 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms