Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ctnna3Q65CL1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ctnna3Q65CL1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms