Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PtprdQ64487 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprdQ64487 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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PtprdQ64487 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PtprdQ64487 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PtprdQ64487 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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