Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clcn1Q64347 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clcn1Q64347 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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