Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Surf4Q64310 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms