Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nup62Q63850 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms