Protein–RNA interactions for Protein: Q62426

Cstb, Cystatin-B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstbQ62426 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CstbQ62426 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CstbQ62426 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms