Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sycp1Q62209 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sycp1Q62209 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms