Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sema3cQ62181 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Sema3cQ62181 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms