Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rbm38Q62176 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rbm38Q62176 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rbm38Q62176 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rbm38Q62176 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rbm38Q62176 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rbm38Q62176 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rbm38Q62176 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rbm38Q62176 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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