Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm20177-201ENSMUST00000203705 334 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm44760-201ENSMUST00000206375 1173 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Olfr1315-ps1-201ENSMUST00000207542 1230 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm13487-201ENSMUST00000122240 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm20659-201ENSMUST00000176599 604 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm37867-201ENSMUST00000192066 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Olfr1121-201ENSMUST00000062555 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC153529.1-201ENSMUST00000217818 370 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Prm3Q62100 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Gm13658-201ENSMUST00000135329 929 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Ermard-209ENSMUST00000226561 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Prm3Q62100 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms