Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itga6Q61739 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga6Q61739 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms