Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klf3Q60980 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms