Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Laptm4aQ60961 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Laptm4aQ60961 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms