Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdkn2cQ60772 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cdkn2cQ60772 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms