Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Samhd1Q60710 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samhd1Q60710 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Samhd1Q60710 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms