Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ItgaeQ60677 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ItgaeQ60677 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms