Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nr2f1Q60632 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nr2f1Q60632 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms