Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NotoQ5TIS6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NotoQ5TIS6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms