Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Specc1Q5SXY1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Specc1Q5SXY1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms