Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r196Q5SVD5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vmn1r196Q5SVD5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms