Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam71bQ5STT6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam71bQ5STT6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms