Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf12Q5SPL2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Phf12Q5SPL2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms